Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00299Q6ZSB3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms