Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms