Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG3Q6UXM1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms