Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VITQ6UXI7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VITQ6UXI7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms