Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms