Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM1Q6UX27 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms