Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRNP1Q6NT89 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms