Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMBOX1Q6NT76 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMBOX1Q6NT76 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HMBOX1Q6NT76 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HMBOX1Q6NT76 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMBOX1Q6NT76 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMBOX1Q6NT76 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMBOX1Q6NT76 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms