Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NANOGP8Q6NSW7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms