Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WSCD1Q658N2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms