Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRAGBQ5VZM2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms