Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MYOM3Q5VTT5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms