Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC7AQ5VTJ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC7AQ5VTJ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC7AQ5VTJ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms