Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms