Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDGFL1Q5TGJ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDGFL1Q5TGJ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms