Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD5Q5TGI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SAMD5Q5TGI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms