Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT6Q5T7P8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms