Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms