Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH8Q5T0T0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms