Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf220Q5T0J3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms