Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CC2D1BQ5T0F9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms