Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COLEC12Q5KU26 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms