Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHC1Q5JVL4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHC1Q5JVL4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms