Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47AQ5JRC9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47AQ5JRC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms