Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAVIN4Q5BKX8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms