Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COBLL1Q53SF7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms