Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDCA8Q53HL2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CDCA8Q53HL2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms