Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms