Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKDCCQ504Y2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKDCCQ504Y2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms