Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms