Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDRF1Q3B7T1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDRF1Q3B7T1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms