Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWISTNBQ3B726 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms