Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPEL1Q2QD12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms