Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC6LQ2NKX8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC6LQ2NKX8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC6LQ2NKX8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC6LQ2NKX8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC6LQ2NKX8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC6LQ2NKX8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms