Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTC1Q2NKJ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms