Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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