Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL24A1Q17RW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL24A1Q17RW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms