Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM187BQ17R55 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms