Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDR2Q16832 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDR2Q16832 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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