Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA3Q16787 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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