Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NREPQ16612 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NREPQ16612 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NREPQ16612 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NREPQ16612 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NREPQ16612 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NREPQ16612 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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