Protein–RNA interactions for Protein: Q16602

CALCRL, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRLQ16602 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCRLQ16602 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms