Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDB1Q16531 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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