Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPE65Q16518 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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