Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TNXAQ16473 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNXAQ16473 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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TNXAQ16473 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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