Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZFHX3Q15911 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms