Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERC1Q15751 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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