Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF11Q15544 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms