Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX1Q15475 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIX1Q15475 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIX1Q15475 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIX1Q15475 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIX1Q15475 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIX1Q15475 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX1Q15475 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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