Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PRKD1Q15139 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PRKD1Q15139 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PRKD1Q15139 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PRKD1Q15139 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PRKD1Q15139 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PRKD1Q15139 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PRKD1Q15139 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms